Assistant-e Doctorant-e PhD

Description de l'offre

Assistant-e Doctorant-e PhDContexteLe Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) est l'un des 5 hôpitaux universitaires suisses. Grâce à sa collaboration avec la Faculté de biologie et médecine de l'Université de Lausanne et l'EPFL, le CHUV joue un rôle de pointe dans les domaines des soins médicaux, de la recherche médicale et de la formation.
Notre groupe fait partie du service d’Endocrinologie, du Diabète et du Métabolisme (EDM) de l’Hôpital Universitaire de Lausanne (CHUV) et affilié à l’Université de Lausanne (UNIL). Notre objectif est d’étudier l’architecture génétique et transcriptionelle des tissus endocriniens, y compris les néoplasies endocrinienne bénigne et maligne. Le groupe est spécialisé dans le développement de pipeline computationnel et d’outils pour l’analyse des données génomiques et transcriptomiques de séquençage à haut-débit y compris le séquençage à cellules uniques (scRNAseq).
Un poste d’assistant doctorant (PhD) est disponible dans le groupe de Dr. Federico Santoni au sein du EDM du CHUV. Contrat renouvelable.Mission
Vous vous concentrez sur la mise au point d’outils pour l’analyse des variantes du génome entier et des données du transcriptome des cellules individuelles pour étudier la population subclonal et le profil transcriptionel des différents adénomes hypophysaires. L’objectif est de trouver des causes génétiques somatiques ou héréditaires d’adénomes pituitaires
Vous appliquez et/ou étendez les outils et les pipelines bioinformatiques disponibles
Vous développez de nouveaux pipelines et algorithmes bioinformatiques pour l’analyse des des données NGS
Vous analysez les données NGS générées par notre groupe et/ou disponibles dans des bases de données publiques
Vous gérez et stockez de grands volumes de données NGS
Vous posez des hypothèses, concevez des expériences computationnelles, présentez et interprétez les résultats
Vous fournissez un soutien bioinformatique pour les autres projets du groupe
Vous vous intégrez avec le reste des membres du service.
Profil
Vous êtes titulaire d'un Master en Bioinformatique, Biologie Computationnelle, Biostatistique ou dans une discipline apparentée
Vous disposez de solides bases en mathématiques (statistiques)
Vous avez d'excellentes compétences en bioinformatique et en programmation (R et Python préférés, Linux/Unix requis)
Vous bénéficiez d'une expérience dans l’analyse des données NGS (p. ex. RNA-Seq, ATAC-Seq, ChIP-Seq, scRNAseq, etc.); avez connaissance des outils bioinformatiques existants et de l’expérience acquise dans le développement de logiciels est un plus
Vous faites preuve d'ouverture d’esprit, êtes désireux d’apprendre et êtes à jour sur les découvertes les plus récentes dans le domaine
Vous avez une volonté de partager les résultats, les idées et les problèmes
Vous faites preuve de curiosité, de créativité et êtes apte à travailler de manière autonome et dans le cadre d’une équipe
Vous maîtrisez l’anglais (oral et écrit), la connaissance du Français est un plus.
Nous offronsDevenir une collaboratrice ou un collaborateur du Centre hospitalier universitaire vaudois, c'est l'assurance de bénéficier :
Vous travaillerez sur un sujet important dans un environnement de recherche dynamique, stimulant et interdisciplinaire avec des technologies de pointe, et avec des conditions d’emploi attrayantes.

De prestations sociales de premier ordre
D'une progression salariale régulière adaptée aux responsabilités
D'un droit à trois jours de formation minimum par année
De 25 jours de vacances par année
De restaurants d'entreprise de qualité hôtelière, dans chacun des bâtiments de l'institution.
Contact et envoi de candidatureContact pour informations sur la fonction : Dr. F. Santoni, au 021 692 55 07.
Dans la mesure où toutes nos candidatures sont traitées de manière électronique, nous vous remercions de postuler exclusivement par internet, en cliquant sur le bouton POSTULER en bas de l’annonce. Si pour des raisons techniques, vous ne pouvez pas postuler en ligne, nous vous invitons à vous rendre physiquement auprès de notre équipe e-recrutement, qui vous accompagnera dans votre démarche (contact : 021.314.85.70). Nous vous répondons du lundi au vendredi de 8h00 à 11h30 et de 13h30 à 16h30.
Le CHUV applique les exigences de qualité les plus élevées dans le cadre de ses processus de recrutement. En outre, soucieux de promouvoir la diversité de nos collaboratrices et collaborateurs, nous sommes attentifs aux différents parcours de vie et mettons tout en œuvre pour garantir l’égalité de traitement et éviter toute discrimination. Nous nous réjouissons de recevoir votre candidature.
Nous remercions par avance les agences de placement de prendre bonne note que les candidatures insérées par leurs soins directement sur notre plateforme de recrutement ne sont pas acceptées et ne peuvent donner lieu à une facturation. Merci de votre compréhension.